POLYMERES A EMPREINTES MOLECULAIRES*

L'impression moléculaire


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Plan de l'étude

1) Généralités

2) Principe de capture de la molécule cible

3) Principe général de synthèse d'un PEM

                3-1) Les composants

                3-2) Les étapes de l'élaboration du PEM

                3-3) Différentes molécules mises en jeu

4) Des exemples de synthèse de PEM

                4-1) Approche covalente

                4-2) Approche non covalente

5) Une application en synthèse

 

Annexe 1 Schéma synoptique d'élaboration d'un PEM


1) Généralités

Les polymères à empreintes moléculaires (PEM) sont des matériaux qui ont la capacité de capturer sélectivement une molécule.

PEM2.gif

On met à profit cette propriété pour analyser des composés à l'état de traces dans des échantillons complexes.

Le développement de ces matériaux est actuellement en plein essor dans divers domaines : séparation chromatographique chirale, tests immunologiques, capteurs, synthèse et catalyse, et notamment capture sélective.

Les techniques de chimie analytique ont profondément évolué ces dernières années afin de répondre à une demande de plus en plus forte dans différents secteurs notamment l’environnement, l’agroalimentaire, et la médecine. Cependant, des difficultés persistent compte tenu de la complexité des échantillons à analyser (sang, urine, eaux de surface, matrice alimentaire) et de la faible teneur en composés recherchés. De nombreuses méthodes physiques, chimiques ou spectroscopiques sont disponibles, mais elles manquent de sélectivité. Dans ce contexte, des outils biomimétiques synthétiques ont été développés. Ils sont fondés sur le principe d’impression moléculaire au même titre que des anticorps, des récepteurs ou encore des enzymes afin de détecter une molécule cible ou d’en évaluer la teneur dans un échantillon. Ces nouveaux matériaux, capables de se lier sélectivement à une cible donnée, ont été baptisés polymères à empreintes moléculaires (MIP en anglais pour Molecularly Imprinted Polymer).

2) Principe de capture de la molécule cible

On a fabriqué le polymère de telle sorte qu'il possède des cavités munies de molécules pouvant s'unir à la cible que l'on étudie.

Deux impératifs à respecter :

            - il faut que les molécules que l'on y place aient des fonctions chimiques leur permettant de se lier à la cible.

            - il faut que dans l'espace, ces molécules soient placées de telle façon qu'elles puissent se lier à la cible suivant un modèle clé-serrure.

PEM3.gif

3) Principe général de synthèse d'un PEM

            3-1) Les composants

Dans cette synthèse il y a quatre intervenants :

                        - Des monomères fonctionnels

 

 PEM01.gif

On en verra des exemples au paragraphe 3-3

 

                        - La molécule cible (ou molécule empreinte)

PEM5      

 

                        - L'agent réticulant

Par polymérisation, il permet la formation de la matrice du polymère

PEM6

et par copolymérisation l'accrochage sur celle-ci de l'ensemble monomères fonctionnels-molécule cible (polymère réticulé).

                        - Le solvant

Il permet de travailler en milieu homogène.

 

            3-2) Les étapes de l'élaboration du PEM

 

                        - Les monomères fonctionnels s'accrochent à une molécule cible, modèle de celles qui devront être captées, pour former un complexe de pré-polymérisation :

PEM7

                        - L'agent réticulant se polymérise et constitue la matrice avec des cavités ; par copolymérisation le complexe de pré-polymérisation s'accroche à la paroi de ces cavités

 

PEM8

 

                        - Par des réactions et des solvants appropriés, on extrait et on élimine la molécule cible des monomères fonctionnels à présent fixés sur la matrice et on obtient le polymère présentant des cavités empreintes de la molécule cible.

PEM9

 

Le polymère obtenu est dit polymère imprimé car il possède des sites de reconnaissance spécifiques de la molécule cible. Cela signifie que si ce PEM est mis en présence de la même molécule cible dans des conditions adéquates, celle-ci pourra se loger dans les sites de reconnaissance (ou cavités) à l’image de sa structure (principe clé-serrure) :

PEM10

 

 Un schéma synoptique  (annexe 1) résume l'ensemble de ces étapes. 

 

3-3) Différentes molécules mises en jeu

On va donner quelques exemples de molécules utilisées comme monomères fonctionnels, comme agents réticulants et comme solvants, puis faire quelques remarques concernant les molécules cibles.

 

                        - Des monomères fonctionnels

 

AACRYLIQUE.gif

AMACRYLIQUE.gif

MACRYLATEDEMETHYLE.gif

ACRYLAMIDE.gif

Acide acrylique

Acide méthacrylique

Méthacrylate de méthyle

Acrylamide

 

MACRYLAMIDE.gif

 

HYDROXYMACRYLATE.gif

STYRENE.gif

AVINYLBENZOÏQUE.gif

Méthacrylamide

2-hydroxyméthacrylate

Styrène

Acide 4-vinylbenzoïque

VINYLPYRIDINE.gif

 

VINYLIMIDAZOLINE.gif

MACRYLATEDETRIMETHANOL.gif

 

TRIFLUOROACRYLIQUE.gif

4-vinylpyridine

1-vinyl-2-imidazoline

Méthacrylate de N-triméthyléthanolamine

Acide 2-(trifluorométhyl)acrylique

ITACONIQUE

AMINOETHACRYL.gif

PHENYLACRYLAMIDE

 

ALLYLAMIDE

Acide itaconique

N-(2-aminoéthyl) méthacrylamide

Phénylacrylamide

Allylamine

 

                        - Les agents réticulants

Rappelons que ce sont les monomères qui constitueront le polymère de la matrice.

 

DIMACRYLATEDETHYLGLYC.gif

DIVINYLBENZENE.gif

TRIMETACRYLATE.gif

 

 

 

PIPERAZINE.gif

Diméthacrylate d'éthylène glycol

1,4- Divinylbenzène

Triméthacrylate de triméthylolpropane

1,4-Bis(acryloyl)pipérazine

PHENYLENDIACRYL

METYLENDIACRYL

ALANINOL

PENTAERYTHR

N,N'-phénylène diacrylamide

N,N'-méthylène diacrylamide

N,O-bisacryloyl-phénylalaninol

Pentaérythritol tétraacrylate

 

                        - Quelques solvants

Le solvant doit être porogène c'est-à-dire capable de créer des cavités dans le polymère.

 

TOLUENE.gif

 

CHLOROFORME.gif

 

DICHLOROMETHANE.gif

 

 

ACETONITRILE.gif

Toluène

Chloroforme

Dichlorométhane

Acétonitrile

 

Remarques :

                                   * Les molécules cibles

Les molécules les plus adaptées sont celles des médicaments, des pesticides, des acides aminés, des peptides, des sucres, des stéroïdes, des nucléotides.

Les grosses molécules (protéines par exemple) ne rentrent pas dans le réseau polymère et ne conviennent donc pas, pour l'instant, à ce type d'analyse.

D'une façon générale les molécules cibles doivent être compatibles avec tous les traitements et les conditions opératoires nécessaires à la formation du complexe de pré-polymérisation et du polymère.

 

                                   * Les initiateurs de polymérisation

Les initiateurs de polymérisation sont des molécules qui restent fixées à l'extrémité de la chaîne qu'ils ont amorcée.

Les polymérisations et copolymérisations qui interviennent dans l'élaboration des PEM sont pratiquement toutes radicalaires.

Les principaux initiateurs de polymérisation sont le 1-1'-Azobis(isobutyronitrile)  ou AIBN qui se décompose par chauffage (60°C) ou sous l'action d'UV et génère des radicaux libres, ou bien le 2,2'-Azobis-(2,4-diméthylvaléronitrile) qui lui aussi se décompose par chauffage mais dès 40°C et permet donc une polymérisation dans des conditions plus douces.

 

AIBN

INIT2

1-1'-Azobis(isobutyronitrile)

2,2'-Azobis-(2,4-diméthylvaléronitrile)

 

Décomposition de l'AIBN :

AIBN2

 

On peut citer aussi le 2,2-diméthoxy-2-phénylacétophénone qui est décomposé par les UV comme l'indique la figure ci-dessous.

RADIC2

 

4) Des exemples de synthèse de PEM

La première étape du processus de synthèse des PEM est la formation d'un complexe de pré-polymérisation par liaison des molécules monomères à la molécule empreinte.

Selon la nature des liaisons qui s'établissent entre le(s) monomère(s) fonctionnel(s) et la molécule empreinte deux types d'approches peuvent être distinguées :

            4-1) Approche covalente

                        - Premier exemple

Dans l’approche covalente, le(s) monomère(s) fonctionnel(s) et la molécule empreinte se lient de manière covalente. L’illustration de la figure ci-dessous montre un exemple pour lequel un seul monomère fonctionnel (un diol) réagit sur la molécule empreinte (ici l'acétophénone). Une fois la polymérisation effectuée, la molécule empreinte est extraite du polymère pour conduire au PEM représenté. Cela implique donc une rupture des liaisons formées au cours de la première étape.

PEMCOVALENT

                                                           PEMCOVALENT3.gif

Le complexe de pré-polymérisation formé est un cétal résultat de la réaction d'un diol sur une fonction cétone.

                        - Deuxième exemple

 

* La molécule empreinte est le [1,1'-binaphtalène]-6,6'-diol

PEMCOVALENTE4.gif

* Le monomère fonctionnel est l'acide méthacrylique

PEMCOVALENT5.gif

 

                                                           PEMCOVALENT7.gif

L'extraction de la molécule empreinte consiste à rompre les liaisons qui relient la molécule empreinte au réseau polymère puis à entraîner la molécule empreinte hors du polymère.

Ceci est réalisé en trois étapes :

            Etape 1 : le polymère précurseur est tout d’abord traité au reflux par une solution aqueuse de soude de concentration égale à 1 mol.L-1 dans du méthanol.

            Etape 2 : le polymère est filtré, rincé, puis acidifié par une solution aqueuse d’acide chlorhydrique (HCl) dans du méthanol.

            Etape 3 : l’entraînement de la molécule empreinte hors du solide précédent est réalisée à chaud avec de l’acétonitrile (CH3CN) comme solvant.

 

            4-2) Approche non covalente

Dans l’approche non covalente, des interactions faibles s’établissent entre le(s) monomère(s) fonctionnel(s) et la molécule empreinte au moment de la formation du complexe de pré-polymérisation.

Le schéma ci-dessous rend compte de cette approche pour le cas d’un dipeptide qui s’associe à cinq monomères fonctionnels identiques dans le complexe de pré-polymérisation. Une fois la polymérisation réalisée, la cassure des liaisons faibles entre le dipeptide et le polymère permet de récupérer le PEM. L’approche non covalente reste la plus utilisée parce que sa mise en œuvre est aisée et qu’un grand nombre de monomères fonctionnalisés sont disponibles commercialement.

 

PEMNONCOV.gif

PEMCOVALENT8

PEMCOVALENT9

Complexe de pré-polymérisation

Polymère précurseur du PEM

PEM

 

5) Une application en synthèse **

Outre les applications de reconnaissance et de dosage de certaines molécules dans des mélanges, il existe d'autres applications comme celle ci-dessous permettant d'orienter une réaction chimique lorsqu'on souhaite par exemple

acyler un stéroïde sur un groupe hydroxyle spécifique en préservant les autres présents dans la molécule.

 

PEMPROTEC4.gif


Annexe 1

Schéma synoptique d'élaboration d'un PEM

 

PEM03.gif


*Article bâti autour du sujet de chimie du concours Agro-Veto 2016 dont il contient de larges extraits.


**Exemple extrait d'un article de l'Actualité chimique 2001 "Polymères à empreintes moléculaires – Principe et applications" (Karsten Haupt, Maître de conférences et Alain Fradet, Professeur).